保山的水资源十分丰富，平均每平方公里产水79万立方米，全市年产水总量达150.7亿立方米（不含澜沧江、怒江干流过境水量），占全省水资源总量的7.5%。

　　境内江河分属澜沧江、怒江、伊洛瓦底江三大水系，流向由北向南。江河沿断裂线发育、呈羽伏分布——

　　①澜沧江水系  由隆阳区东北瓦窑乡入境，经水寨、瓦渡、昌宁大田坝，至漭水流入临沧地区凤庆县。境内流长116.5公里，江面海拔1030~1240米，集水面积2210平方公里，年平均产水量11.49亿立方米，最大流量每秒856立方米。过境较大支流有瓦窑河、永平河、黑惠江。发源于本市的较大支流有古甸河。

　　②怒江水系   由隆阳区瓦马、芒宽乡入境，流经施甸县，至龙陵县木城乡万马河口出境。境内流长252公里，江面海拔523~900米，集水面积10511平方公里，年平均产水量58.04亿立方米，年平均流量1656立方米/秒。发源于本市较大的支流有施甸河、苏帕河、枯椅河，边境较大的支流有镇康河。③伊洛瓦底江水系   伊洛瓦底江的两大支流——大盈江和龙川江发源于腾冲县。大盈江上游又有两条支流，一为槟榔江，一为大盈江。槟榔江发源于腾冲县西北部五台山一带，于古永芭蕉林流入盈江县。境内流长59公里，集水面积1070平方公里，年平均径流量19亿立方米。大盈江发源于腾冲东北部打苴一带，经县城、和顺乡、荷花乡流入梁河县。